鸭不同肠段内菌群结构分析与拟杆菌分布研究

• 作者: 刘宏祥 原志伟 宋卫涛 徐文娟 朱春红 李慧芳 章双杰 陶志云
• 来源期刊: 畜牧兽医学报
• 学科: 农学
• 关键词: 16SrRNA测序 菌群 肠道 拟杆菌 鸭
• 年，卷（期）: 2020,（12）
• 所属期刊栏目: 遗传育种
• 页码范围: 3001-3012
• 页数: 12页
• 分类号: S852.6|S834
• 语种: 中文
• DOI: 10.11843/j.issn.0366-6964.2020.12.010

摘要

旨在分析健康鸭十二指肠、空肠、回肠和盲肠内容物菌群组成、多样性特征以及拟杆菌分布.本研究选择健康高邮鸭20只,公母各半,70日龄时无菌采集十二指肠、空肠、回肠和盲肠内容物,提取肠道内容物细菌基因组,利用IonS5TMXL平台进行高通量测序,分析肠道内容物菌群结构与丰度特征以及拟杆菌的分布.结果表明,十二指肠、空肠内容物菌群丰度显著高于回肠和盲肠内容物(P<0.05),回肠内容物菌群多样性最低;十二指肠和空肠内菌群群落结构较为相似,与回肠,特别是盲肠的相似度较小.健康鸭肠内优势菌门为拟杆菌门(Bacteroidetes)、厚壁菌门(Firmicutes)、变形菌门(Proteobacteria)和梭杆菌门(Fusobacteria),上述菌门在各肠段内容物中相对丰度不同;不同肠段内容物中定植了不同差异微生物物种,十二指肠、空肠、回肠和盲肠内容物中差异菌门分别是变形菌门、放线菌门(Actinobacteria)、厚壁菌门和拟杆菌门.鸭肠道中共分析到28种拟杆菌种,其中B.acidif aciens、B.barnesiae、B.caccae、B.caecicola、B.coprocola、B.sp和B.luti在盲肠内容物中显著聚类,且B.caecigalli-narum、B.p lebeius和B.barnesiae在鸭盲肠中优势定植.结果显示,鸭肠段空间显著影响了其内容物中菌群丰度与多样性,不同肠段内定植了差异的优势微生物物种,这可能与肠段小环境以及功能一致,在盲肠内容物中优势定植拟杆菌,推测可能与鸭盲肠生理生化功能相关.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李慧芳		112	611	10.0	21.0
2	徐文娟		74	184	7.0	8.0
3	章双杰		55	145	7.0	10.0
4	刘宏祥		42	70	5.0	6.0
5	宋卫涛		75	185	7.0	8.0
6	朱春红		57	148	6.0	9.0
7	陶志云		46	76	5.0	6.0
8	原志伟		2	0	0.0	0.0