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链格孢菌毒素胁迫下的棘孢木霉转录组构建及生防基因差异表达
链格孢菌毒素胁迫下的棘孢木霉转录组构建及生防基因差异表达
作者:
刘志华
安一博
张平
韩静
马玲
原文服务方:
东北林业大学学报
棘孢木霉
链格孢菌
真菌毒素
转录组学
生防功能基因
摘要:
为了探究链格孢菌(Alternaria alternata)毒素胁迫条件下木霉的功能调控网路,在毒素胁迫的不同时间取样测序,建立了毒素胁迫下棘孢木霉(Trichoderma asperellum)CGMCC11653的转录组.结果表明:各样品的Reads与参考基因组的比对效率为95.63%~97.50%,所选参考基因组组装能够满足信息分析的需求.毒素胁迫后,木霉中有3866个变化的差异表达基因;GO分类发现6、12、48 h的转录本在生物学过程、分子功能和细胞组分3个类别中分别富集了292、551、3023个基因.对在不同时间点下木霉调控的防卫基因分析发现,毒素胁迫12 h前各类抗病基因变化并不明显,但胁迫48 h后木霉调控了大部分抗病相关基因做出反应,包括ABC转运蛋白ABC1(3.44倍)、热激蛋白基因Hsp1(2.41倍)、葡聚糖基因Glucan16(2.91倍)等,表明木霉可以通过相关抗性基因病原真菌毒素胁迫进行精准调控.
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篇名
链格孢菌毒素胁迫下的棘孢木霉转录组构建及生防基因差异表达
来源期刊
东北林业大学学报
学科
关键词
棘孢木霉
链格孢菌
真菌毒素
转录组学
生防功能基因
年,卷(期)
2020,(11)
所属期刊栏目
研究方向
页码范围
105-110,116
页数
7页
分类号
S763.1
字数
语种
中文
DOI
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姓名
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1
马玲
102
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刘志华
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张平
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链格孢菌
真菌毒素
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生防功能基因
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
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相关学者/机构
期刊影响力
东北林业大学学报
主办单位:
东北林业大学
出版周期:
月刊
ISSN:
1000-5382
CN:
23-1268/S
开本:
大16开
出版地:
邮发代号:
创刊时间:
1957-01-01
语种:
chi
出版文献量(篇)
7235
总下载数(次)
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