圆臀大黾蝽线粒体基因组密码子偏好性与COI基因适应性进化研究

• 作者: 伊文博 刘佳 张敏 柳大军 赵婉清 高志忠
• 来源期刊: 安徽农学通报
• 学科: 农学
• 关键词: 圆臀大黾蝽 线粒体 密码子偏好性 COI 选择压力
• 年，卷（期）: 2020,（8）
• 所属期刊栏目: 分子生物·遗传育种
• 页码范围: 10-14
• 页数: 5页
• 分类号: S432.44|Q78
• 字数: 3641字
• 语种: 中文

摘要

利用CodonW、MEGA、EasyCodeML、CAIcal等软件及在线程序分析密码子偏好性相关参数(GC含量、ENC值、CAI值和CBI值),以明确圆臀大黾蝽线粒体蛋白编码基因的密码子使用偏好性和COI基因的适应性进化.通过中性绘图和ENC-plot分析了密码子偏好性的形成原因,采用位点模型研究COI基因的选择压力.结果表明,多数最优密码子以U结尾,RSCU值较高的密码子大部分都以A/U结尾;中性绘图和ENC-plot分析表明密码子偏好性主要受选择压力的影响;选择压力分析表明COI基因受到较强的纯化选择的作用,没有发现正选择位点.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张敏	忻州师范学院生物系	8	26	4.0	5.0
2	刘佳	忻州师范学院生物系	4	0	0.0	0.0
3	赵婉清	忻州师范学院生物系	2	0	0.0	0.0
4	柳大军	忻州师范学院生物系	2	0	0.0	0.0
5	伊文博	忻州师范学院生物系	4	0	0.0	0.0
6	高志忠	忻州师范学院生物系	3	0	0.0	0.0