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基于LC-MS技术的患乳腺癌猫血清代谢组学分析
基于LC-MS技术的患乳腺癌猫血清代谢组学分析
作者:
侯凯文
周志新
王峥
邓朝阳
郑家三
韦人月
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
猫
乳腺癌
LC-MS
差异代谢产物
摘要:
本试验旨在研究患乳腺癌猫与健康猫体内差异代谢物的变化情况,并探讨差异代谢物与猫乳腺癌发生之间的关系.本试验选取临床收集的经组织病理学确诊的猫乳腺癌血清样本6例作为试验组(T组),同时选取年龄相似,品种相同的健康猫血清6例作为对照组(C组).运用超高效液相色谱质谱联用技术(liquid chromatographymass spectrometry,LC-MS)对两组猫的血清样本进行检测,采用无监督的主成分分析(principal component analysis, PCA)、正交偏最小二乘法-判别分析(orthogonal projections to latent structures-discriminant analysis,OPLS DA)及学生t检验(Student's t-test)筛选出差异代谢物,然后再对筛选出的差异代谢物进行层次聚类分析(hierarchical clustering analysis,HCA),并进行差异代谢物的KEGG注释及差异代谢物的代谢通路分析.结果 表明,在两组样本中共定性到159种差异代谢物.与C组相比,在T组中有49种差异代谢物出现下调,110种差异代谢物出现上调.最终共筛选出5种与猫乳腺癌发生发展密切相关的差异代谢产物.与C组相比,T组中麦角硫因(ergothioneine,EGT)和肌酸(creatine)出现下调,吲哚乙酸(indolelactic acid,IAA)、胆碱(choline)和尿酸(uric acid)出现上调.这些差异代谢物表明,在猫乳腺癌的发生过程中,机体变化涉及了甘氨酸、丝氨酸和苏氨酸代谢、精氨酸和脯氨酸代谢、组氨酸代谢、色氨酸代谢、嘌呤代谢异常和甘油磷脂代谢等多个代谢途径,为今后深入研究猫乳腺癌的发病机制开辟了一个新的思路.
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文献信息
篇名
基于LC-MS技术的患乳腺癌猫血清代谢组学分析
来源期刊
畜牧兽医学报
学科
农学
关键词
猫
乳腺癌
LC-MS
差异代谢产物
年,卷(期)
2020,(9)
所属期刊栏目
临床兽医
研究方向
页码范围
2293-2301
页数
9页
分类号
S858.293.7.26
字数
语种
中文
DOI
10.11843/j.issn.0366-6964.2020.09.027
五维指标
作者信息
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差异代谢产物
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
畜牧兽医学报
主办单位:
中国畜牧兽医学会
出版周期:
月刊
ISSN:
0366-6964
CN:
11-1985/S
开本:
大16开
出版地:
北京海淀区圆明园西路2号
邮发代号:
82-453
创刊时间:
1956
语种:
chi
出版文献量(篇)
5501
总下载数(次)
6
总被引数(次)
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