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基于异质网络层次注意力机制的基因功能预测
基于异质网络层次注意力机制的基因功能预测
作者:
万美含
朱扬勇
熊贇
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
基因功能预测
异质信息网络
注意力机制
网络表示学习
网络嵌入
摘要:
基因组测序技术的快速发展使得生物数据库中的基因和基因组序列数据数量迅速增加,但其中仍有大量基因功能是未知的.为此,提出基于异质网络层次注意力机制的基因节点表示学习方法HAGE,用以预测基因功能.结合多种来源的数据集,构建一个具有节点属性的基因功能相关异质网络,在网络中使用层次注意力机制为每一个基因节点学习一个节点嵌入向量,该向量可用于后续的基因功能预测等任务.实验结果表明,与GraphSAGE和GAT等方法相比,HAGE具有更好的预测性能.
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方面词
情感分类
自注意力机制
语义编码
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内容分析
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相关文献总数
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文献信息
篇名
基于异质网络层次注意力机制的基因功能预测
来源期刊
计算机工程
学科
工学
关键词
基因功能预测
异质信息网络
注意力机制
网络表示学习
网络嵌入
年,卷(期)
2020,(7)
所属期刊栏目
人工智能与模式识别
研究方向
页码范围
43-49
页数
7页
分类号
TP18
字数
5692字
语种
中文
DOI
10.19678/j.issn.1000-3428.0054805
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
朱扬勇
复旦大学计算机科学技术学院
91
3435
25.0
58.0
4
熊贇
复旦大学计算机科学技术学院
11
20
3.0
4.0
13
万美含
复旦大学计算机科学技术学院
1
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引证文献(0)
二级引证文献(0)
研究主题发展历程
节点文献
基因功能预测
异质信息网络
注意力机制
网络表示学习
网络嵌入
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
计算机工程
主办单位:
华东计算技术研究所
上海市计算机学会
出版周期:
月刊
ISSN:
1000-3428
CN:
31-1289/TP
开本:
大16开
出版地:
上海市桂林路418号
邮发代号:
4-310
创刊时间:
1975
语种:
chi
出版文献量(篇)
31987
总下载数(次)
53
总被引数(次)
317027
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:
the National Natural Science Foundation of China
官方网址:
http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:
青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:
数理科学
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