散发孤独症谱系障碍核心家系神经-突触发育相关共有变异基因分析

• 作者: 付磊 司徒明镜 张慧 张漫雪 杨婵 杨平原 焦建 胡霄 蔡佳 郭奎芳 黄延 黄颐
• 来源期刊: 中华医学遗传学杂志
• 关键词: 孤独症谱系障碍 全外显子测序 基因-表型关联 通路富集分析
• 年，卷（期）: 2020,（1）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 1-4
• 页数: 4页
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/cma.j.issn.1003-9406.2020.01.001

摘要

目的:探讨散发孤独症谱系障碍(autism spectrum disorders, ASD)核心家系患儿的疾病易感基因。方法:对60例散发ASD核心家系患儿及父母进行全外显子测序。选取总体样本10%以上患者共存的变异基因，应用Phenolyzer数据库进行基因-表型关联评分，进一步利用metascape数据库进行基因功能通路富集分析，重点关注与神经-突触发育相关的通路或过程基因，结合基因-表型得分筛选ASD易感基因。结果:共发现170个共有基因与ASD表型相关，其中高置信基因(high-confidence gene)1个： SHANK2(0.8146分)；中置信基因(medium-confidence gene)4个： ERBB2(0.1322分)、 LAMC3(0.1117分)、 PPFIA4(0.1059分)、 DISC1(0.1002分)。通过基因功能通路富集分析发现20条通路及生物学过程达到统计学意义，其中投射神经元形态发生(GO：0048812)、神经母细胞增殖的调控(GO：1902692)、兴奋性突触后电位的调节(GO：0098815)、树突形态发生(GO：0048813)等4个生物学过程，共计21个基因与神经-突触发育相关，其中 SHANK2、ERBB2、DISC1基因为中度以上置信基因。 结论:投射神经元形态发生(GO：0048812)过程异常可能与ASD的发生密切相关， SHANK2、ERBB2、DISC1基因可能是ASD的遗传易感基因。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张慧		67	252	8.0	13.0
2	司徒明镜		22	98	6.0	9.0
3	黄颐		69	356	10.0	16.0
4	黄延		2	3	1.0	1.0
5	张漫雪		4	1	1.0	1.0
6	杨平原		2	1	1.0	1.0
7	胡霄		7	24	2.0	4.0
8	郭奎芳		4	12	1.0	3.0
9	付磊		14	28	3.0	5.0
10	蔡佳		5	12	1.0	3.0
11	杨婵		6	27	3.0	5.0
12	焦建		1	0	0.0	0.0