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印度南瓜Na+/H+逆向转运蛋白基因CmaSOS1的克隆与表达分析
印度南瓜Na+/H+逆向转运蛋白基因CmaSOS1的克隆与表达分析
作者:
吕远大
时丕彪
洪立洲
王伟义
王军
费月跃
顾闽峰
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
印度南瓜
CmaSOS1基因
基因克隆
序列分析
表达分析
摘要:
Na+/H+逆向转运蛋白(SOS1)是植物耐盐的关键因子之一,在植物响应非生物胁迫过程中发挥着重要作用.为解析印度南瓜SOS1基因的序列特征和功能,利用生物信息学和分子生物学方法对其进行研究.结果 表明,克隆获得印度南瓜SOS1基因cDNA全长序列,命名为CmaSOS1,GenBank登录号:NW_019272028.序列分析表明,CmaSOS1基因的cDNA全长3 940 bp,包含一个3 429 bp的开放阅读框架,编码1 142个氨基酸.CmaSOS1基因含有23个外显子和22个内含子,全长46 314 bp.CmaSOS1蛋白的分子量为126.7 kDa,理论等电点为5.92,包含12个跨膜结构区域,具有一个Na_H_Exchanger superfamily结构域和一个CAP_ED superfamily结构域;CmaSOS1蛋白属于疏水性稳定蛋白,二级结构元件多为无规卷曲和α--螺旋.CmaSOS1蛋白与葫芦科的中国南瓜、西葫芦、甜瓜、黄瓜和苦瓜Na+/H+逆向转运蛋白的同源性较高,序列一致性分别为98%、98%、90%、89%和89%.实时荧光定量PCR分析表明,CmaSOS1基因在印度南瓜的根和叶中表达量较高,在茎、花、果实中的表达量较低;该基因受NaC1和聚乙二醇(PEG)诱导后均呈上调表达,推测CmaSOS1基因可能在印度南瓜抵御盐分胁迫和干旱胁迫过程中发挥重要作用.本研究为进一步揭示CmSOS1在非生物胁迫下的功能奠定了基础.
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篇名
印度南瓜Na+/H+逆向转运蛋白基因CmaSOS1的克隆与表达分析
来源期刊
核农学报
学科
关键词
印度南瓜
CmaSOS1基因
基因克隆
序列分析
表达分析
年,卷(期)
2020,(12)
所属期刊栏目
植物诱变育种·农业生物技术
研究方向
页码范围
2638-2646
页数
9页
分类号
字数
语种
中文
DOI
10.11869/j.issn.100-8551.2020.12.2638
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核农学报
主办单位:
中国原子能农学会
中国农业科学院农产品加工研究所(前中国农业科学院原子能利用研究所)
出版周期:
月刊
ISSN:
1000-8551
CN:
11-2265/S
开本:
16开
出版地:
北京市海淀区圆明园西路2号农产品加工研究所
邮发代号:
创刊时间:
1987
语种:
chi
出版文献量(篇)
4988
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