miR-4472的靶基因预测及生物信息学分析

• 作者: 侯秋英 刘珏 张旭 朱雯 沈方方 滕懿群 陈星光
• 来源期刊: 浙江医学
• 关键词: 新生儿缺氧缺血性脑病 miR-4472 靶基因 信号通路 生物信息学
• 年，卷（期）: 2020,（13）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 1377-1380
• 页数: 4页
• 字数: 3067字
• 语种: 中文
• DOI: 10.12056/j.issn.1006-2785.2020.42.13.2019-3553

摘要

目的 应用生物信息学分析方法 预测miR-4472的靶基因及信号通路.方法 利用miRBase数据库分析miR-4472的物种保守性;利用Targetscan、miRDB数据库进行靶基因预测,再用DAVID数据库将miR-4472的预测靶基因集合进行基因本体(GO)功能富集分析及京都基因与基因组百科全书(KEGG)生物通路富集分析.结果 miR-4472预测的交集靶基因共378个.GO分析结果 显示,miR-4472的靶基因主要参与转录的正负调节、 细胞凋亡、 蛋白质磷酸化等生物过程(均P<0.01).KEGG信号通路分析结果 显示,miR-4472的靶基因显著富集于PI3K-Akt信号通路、胰高血糖素相关信号通路、心肌细胞中的肾上腺素能信号传导通路、醛固酮的合成和分泌相关信号通路(均P<0.05).结论 miR-4472靶基因富集的信号通路均与新生儿缺氧缺血性脑病密切相关,尤其是P13K/AKt信号通路.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈星光	嘉兴市第二医院小儿骨科	1	0	0.0	0.0