冰草SSR-PCR体系优化及验证

• 作者: 于卓 于肖夏 卢倩倩 吴国芳 张明飞 李景伟 杨东升
• 来源期刊: 草业科学
• 关键词: 冰草 SSR-PCR 优化 验证 分子标记辅助育种
• 年，卷（期）: 2020,（9）
• 页码范围: 1760-1769
• 页数: 10页
• 语种: 中文
• DOI: 10.11829/j.issn.1001-0629.2020-0149

摘要

以蒙古冰草(Agropyron mongolicum var. mongolicum) DNA为模板，利用单因素与正交试验设计相结合的方法，对影响冰草SSR-PCR体系的dNTP浓度、Mg2+浓度、引物浓度、模板DNA浓度和Taq DNA聚合酶用量5个因素进行优化。结果表明，冰草SSR-PCR的最佳体系为：dNTP浓度250 μmol·L–1、Mg2+浓度2.25 mmol·L–1、引物浓度0.60 μmol·L–1、模板DNA浓度40 ng·μL–1和Taq DNA聚合酶用量0.75 U，其余为ddH2O，反应总体积为20 μL。本研究筛选出适于冰草SSR-PCR的最佳反应体系，可提高冰草SSR扩增条带的清晰度和可靠性，这为后续深入开展冰草的遗传作图、重要性状QTL定位及分子标记辅助育种等研究奠定了基础。