基于比较转录组的夏枯草组织差异表达分析

• 作者: 张梦佳 朱畇昊 李璐 董诚明 赵乐
• 来源期刊: 中草药
• 学科: 医学
• 关键词: 转录组 夏枯草 表达分析 Unigenes P450 果穗 茎 叶片
• 年，卷（期）: 2020,（13）
• 所属期刊栏目: 药材与资源
• 页码范围: 3523-3529
• 页数: 7页
• 分类号: R282.12
• 语种: 中文
• DOI: 10.7501/j.issn.0253-2670.2020.13.021

摘要

目的 分析夏枯草Prunella vulgaris果穗、茎、叶片转录组,挖掘夏枯草次生代谢产物生物合成的功能及调节基因.方法 利用Illumina高通量测序技术对夏枯草不同组织进行转录组测序,并从差异表达的基因中鉴定次生代谢物生物合成的相关酶基因.结果 在夏枯草的3个不同组织的转录本中,共有8 270个Unigenes在至少2个样品间差异显著.对不同组织差异表达的基因进行KEGG富集分析,结果表明,不同组织中苯丙素类生物合成的基因表达均有较大的变化.在夏枯草差异基因中分别搜索三萜类和酚酸类生物合成途径的关键酶,共鉴定到31个三萜类生物合成相关的Unigene,16个酚酸类生物合成相关的Unigenes,113个P450相关的Unigenes.结论 本研究为后续发掘夏枯草次生物质代谢合成途径相关功能基因提供依据,也为夏枯草次生代谢物的生物合成调控研究奠定基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	董诚明	河南中医药大学药学院	140	944	15.0	24.0
3	赵乐	河南中医药大学药学院	45	96	6.0	8.0
7	朱畇昊	河南中医药大学药学院	21	44	4.0	5.0
9	张梦佳	河南中医药大学药学院	6	7	1.0	2.0
10	李璐	河南中医药大学药学院	25	72	5.0	7.0