山茱萸CoDXR基因的克隆与分析

• 作者: 于红卫 侯典云 侯小改 徐静雅 李志红 杨萌萌 王瑶瑶
• 来源期刊: 中草药
• 学科: 医学
• 关键词: 山茱萸 1-脱氧-D-核酮糖5-磷酸还原酶(DXR) 代谢途径 基因克隆 氨基酸
• 年，卷（期）: 2020,（14）
• 所属期刊栏目: 药材与资源
• 页码范围: 3785-3790
• 页数: 6页
• 分类号: R282.12
• 语种: 中文
• DOI: 10.7501/j.issn.0253-2670.2020.14.024

摘要

目的 克隆山茱萸关键酶基因1-脱氧-D-核酮糖5-磷酸还原酶(CoDXR)的全长cDNA序列,为山茱萸的进一步研究提供依据.方法 以本实验室获得的山茱萸转录组数据中的转录本序列c147202_g1为模板,通过Primer Premier 5.0设计特异性引物,利用RT-PCR技术克隆CoDXR基因的全长cDNA序列,并通过相关的生物信息学软件对其进行相关的生物信息学分析和功能预测.结果 CoDXR基因长度为1 505 bp,ORF长度是729 bp,编码242个氨基酸.而通过SignalP4.0Server和HMMTOP对CoDXR蛋白预测分析结果可知,该蛋白不具有信号肽和跨膜区,为疏水性蛋白.系统进化树分析结果表明CoDXR蛋白与野茶树(Camellia sinensis)的DXR蛋白序列相似性最高.结论 在山茱萸果实和叶片转录组测序的基础上成功克隆了山茱萸萜类合成途径中的关键酶基因CoDXR,对其进行相关的生物信息学分析,为深入研究CoDXR基因在山茱萸萜类合成途径中的功能奠定了基础.