一例白血病患者及家系HLA-B基因全长序列及18个点突变分析

• 作者: 全湛柔 洪文旭 邓志辉 邹红岩 钟艳平
• 来源期刊: 中国组织工程研究
• 学科: 医学
• 关键词: 白血病 人类白细胞抗原 新等位基因 下一代测序技术 家系调查 碱基突变 序列特异性寡核苷酸探针杂交 聚合酶链反应-直接测序法
• 年，卷（期）: 2020,（1）
• 所属期刊栏目: 造血干细胞
• 页码范围: 77-82
• 页数: 6页
• 分类号: R459.5|R394|R552
• 字数: 6857字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.2095-4344.1859

摘要

背景:人类白细胞抗原HLA经过长期进化形成丰富的多态性,近几年由于受检人数增加及HLA分型技术快速发展,HLA新基因不断被发现.目的:采用下一代测序技术对1例白血病患者及家系HLA-B基因的全长序列及18个点突变进行分析.方法:应用序列特异性寡核苷酸探针杂交(PCR-SSOP)及聚合酶链反应-直接测序法(PCR-SBT)发现患者的HLA-B结果异常.为了鉴定该基因,采用下一代测序技术对该基因全长进行测序,同时采集患者父亲、母亲及2位同胞姐妹的血样进行HLA基因的遗传学分析.结果与结论:应用序列特异性寡核苷酸探针杂交及聚合酶链反应-直接测序法均提示该样本HLA-B无完全匹配的基因型.应用下一代测序技术分析发现,与同源性最高的等位基因B*15:09:01相比,该基因在外显子、内含子和3′UTR共存在18个碱基突变.5个外显子碱基突变位于第3,4外显子,分别为:第486位G→C、第583位T→C、第636位T→C、第652位A→G和第756位C→T,导致5个相应密码子发生改变,其中2个碱基替换为错义突变,第171位酪氨酸(Tyr)→组氨酸(His)、第194位异亮氨酸(Ile)→缬氨酸(Val).家系调查显示患者HLA-B新基因来源于父亲.新基因序列已递交给Genbank数据库(MG595995).应用下一代测序技术鉴定了1个HLA-B新等位基因,该基因于2017年12月被WHO HLA因子命名委员会正式命名为HLA-B*15:435.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	邹红岩	深圳市血液中心输血医学研究所	49	152	6.0	9.0
2	邓志辉	深圳市血液中心输血医学研究所	66	218	7.0	11.0
3	洪文旭	深圳市血液中心输血医学研究所	17	15	2.0	2.0
4	钟艳平	深圳市血液中心输血医学研究所	4	1	1.0	1.0
5	全湛柔	深圳市血液中心输血医学研究所	5	3	1.0	1.0