基于ceRNA探讨白藜芦醇干预肾透明细胞癌的有效机制

• 作者: 谢天琪 裴丽霞 宋亚芳 孙梦珠 赵婷婷 易越 孙建华
• 来源期刊: 世界科学技术-中医药现代化
• 关键词: 肾透明细胞癌 ceRNA网络 白藜芦醇
• 年，卷（期）: 2020,（12）
• 所属期刊栏目: 中药研究|Chinese Materia Medica
• 页码范围: 4285-4292
• 页数: 8页
• 分类号: R284
• 语种: 中文
• DOI: 10.11842/wst.20200103004

摘要

目的 利用从肾透明细胞癌(ccRCC)数据集中筛选的差异表达基因、差异lncRNA及其上游miRNA,探索白藜芦醇可能的作用靶点,构建ccRCC的ceRNA网络.方法 从基因表达综合数据(GEO)及转录组数据库(TCGA)中检索并筛选ccRCC基因及lncRNA表达数据集,对差异表达基因(DEGs)进行富集和功能注释,使用在线数据库预测miRNA及长链非编码RNA (lncRNA),通过加权基因共表达网络分析(WGCNA)鉴定该机制中可能的lncRNA,建立竞争性内源性RNA(ceRNAs)调控网络,并通过网络药理学分析确定白藜芦醇的药物靶点,探索白藜芦醇治疗ccRCC的分子作用机制.结果 构建了AL136040.1、SNHG17与上游hsa-miR-25-3p、hsa-miR-23a-3p及COL1A2、HRG的ceRNA调控网络,白藜芦醇与两个mRNA均显示良好的对接打分.结论 可能存在AL136040.1、SNHG17两个lncRNA与hsa-miR-25-3p、hsa-miR-23a-3p竞争性调控COL1A2、HRG,进一步影响ccRCC预后,可能是白藜芦醇治疗ccRCC的潜在机制.