致尤文肉瘤转移的关键基因及预后、调控分析

• 作者: 冯虎 卜祥博 曲哲 朱先任 李子昂 潘彬 经历 罗选翔 郭迪 霍添群 高啸
• 来源期刊: 中华医学杂志
• 关键词: 尤文肉瘤 生物信息学 信号通路 生存分析 调控分析
• 年，卷（期）: 2020,（19）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 1505-1510
• 页数: 6页
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/cma.j.cn112137-20190929-02136

摘要

目的 使用生物信息学技术分析转移性尤文肉瘤的关键基因及其预后、调控.方法 基于高通量数据筛选出了与尤文肉瘤(ES)转移相关的差异表达基因(DEGs),并将DEGs进行基因本体(GO)功能注释及京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析.将富集结果结合基因表达水平验证及癌症基因组图谱(TCGA)数据库的生存分析,筛选关键基因.使用EWS-FLI1敲低的A673细胞系基因序列进行关键基因与EWS-FLI1之间表达量的相关性分析,并初步分析与ES转移相关的miRNA调控网络.结果 筛选出DEGs为380个.得到2条与ES转移相关的重要通路:错配修复(MMR)通路(P=0.048)、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)信号通路(P=0.037);4个关键基因:MSH2、MSH6、CACNA2D2和MET.有61种miRNAs可能调控着关键基因的表达.ES患者的生存分析结果显示,4个关键基因的高表达量组5年生存率均低于低表达量组;TCGA数据库中肉瘤患者生存分析结果显示,4个关键基因的高表达也同样降低了患者的生存率,其在肉瘤的疾病进展中是危险因素.此外,与EWS-FLI1之间表达量的相关性分析显示,EWS-FLI1融合基因可能调控着4个关键基因的表达.结论 目前的研究结果表明,MMR、MAPK通路及关键基因MSH2、MSH6、CACNA2D2和MET对ES增殖、侵袭和迁移有促进作用,并且与尤文肉瘤患者的预后相关.