基于文献挖掘与分子对接技术的瑶药“十八钻”抗新型冠状病毒活性成分筛选

• 作者: 侯小涛 张萌 杜正彩 梁跃辉 潘祥龙 王星圆 秦健峰 苏梓霞 蓝滴 邓家刚 郝二伟
• 来源期刊: 中草药
• 学科: 医学
• 关键词: 新型冠状病毒 新型冠状病毒肺炎 瑶药 十八钻 血管紧张素转化酶 3CL水解酶 分子对接 抗病毒
• 年，卷（期）: 2020,（8）
• 所属期刊栏目: 抗新冠肺炎专栏
• 页码范围: 2024-2034
• 页数: 11页
• 分类号: R284.1
• 语种: 中文
• DOI: 10.7501/j.issn.0253-2670.2020.08.006

摘要

目的 采用文献挖掘与分子对接技术相结合的方法筛选瑶药“十八钻”中潜在的抗新型冠状病毒(SARS-CoV-2)活性成分及寻找潜在的治疗新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的瑶药.方法 依据瑶医传统用法及临床实践以瑶药“十八钻”为候选药物,通过文献挖掘与TCMSP、ETCM、TCMID、NPASS数据库搜集整理瑶药“十八钻”的化学成分.将搜集到的成分分别与SARS-CoV-2 3CL水解酶(Mpro)及血管紧张素转化酶2(ACE2)进行分子对接.收集两者对接得分值排名前50的成分构建中药-成分-靶点网络图,以优选活性成分,推测关键瑶药.结果 通过文献挖掘与中药数据库搜集共得到902个化学成分,通过分子对接得到与Mpm结合较好的成分219个,与ACE2结合较好的成分448个,其中槲皮素-3-O-α-L-呋喃阿拉伯糖苷、山柰酚-3-O-α-D-吡喃阿拉伯糖苷、鞣酸、胭脂虫酸、绿原酸、芦丁、西阿尼醇等成分对SARS-CoV-2具有潜在的抑制作用,关键的活性成分主要来源于双钩钻、槟榔钻、大钻、地钻、白钻、小红钻、小钻、九龙钻、四方钻等瑶药.结论 从瑶药“十八钻”中筛选出潜在的抗SARS-CoV-2中药单体,为寻找Mpro和ACE2的中药小分子抑制剂以及推测潜在抗COVID-19中药提供参考.