基于Oncomine数据库及生物信息学方法挖掘卵巢癌PSME2基因表达意义及作用机制

• 作者: 冷天艳 张琴 李晓阳 杨丽华 殷雪琴
• 来源期刊: 重庆医学
• 学科: 医学
• 关键词: 卵巢肿瘤 人蛋白酶激活复合体亚基2 Oncomine数据库 Genecards 生物信息学
• 年，卷（期）: 2020,（8）
• 所属期刊栏目: 生物信息学
• 页码范围: 1350-1353,1357
• 页数: 5页
• 分类号: R737.31
• 字数: 2652字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1671-8348.2020.08.032

摘要

目的 基于Oncomine数据库及cBioPortal挖掘人蛋白酶激活复合体亚基2(PSME2)基因在卵巢癌细胞中的表达及可能的作用机制,为深入研究PSME2在卵巢癌中的作用提供理论依据.方法 对Onco-mine数据库中PSME2基因在卵巢癌中表达的13项研究数据进行荟萃分析,在cBioPortal在线数据库应用Kaplan-Meier法分析PSME2表达水平与卵巢癌患者生存时间的关系,探讨其临床意义,应用Genecards数据库收集与PSME2基因相关的蛋白,并通过STRING绘制PSME2相关蛋白网络图,随后结合DAVID在线软件分析蛋白富集的生理过程.结果 挖掘Oncomine数据库中关于卵巢癌细胞及正常卵巢细胞中PSME2基因表达的13项研究数据,卵巢癌中PSME2基因的表达显著高于正常卵巢(P<0.05).Kaplan-Meier生存曲线分析发现,卵巢癌患者中高表达PSME2基因的无病生存率、总生存率均显著低于低表达组(P<0.05).通过Genecards数据库收集到与PSME2相关的蛋白有TRAF2、RELB、NFKBIA、VHL等25个,其相关蛋白富集分析结果 显示PSME2相关蛋白主要富集在蛋白酶体介导的泛素依赖型蛋白分解代谢、免疫监视及免疫杀伤、病毒致癌、调控细胞转录、细胞分化、细胞周期等生理过程.结论 PSME2基因在卵巢癌组织中呈高表达,其可能通过调节蛋白酶体介导的蛋白分解代谢,使肿瘤细胞逃脱免疫监视与免疫杀伤而发挥癌基因作用,该基因可能作为卵巢癌诊治的一个靶点,但其具体的作用机制需要进一步研究和实验验证.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	杨丽华		69	195	7.0	10.0
2	张琴		25	38	3.0	4.0
3	冷天艳		24	35	4.0	4.0
4	殷雪琴		5	0	0.0	0.0
5	李晓阳		2	0	0.0	0.0