水稻种子总RNA提取质量问题的探究

• 作者: 崔欢 王长龙 肖武名 谢月兰 陈志强
• 来源期刊: 中国农学通报
• 学科: 生物学
• 关键词: 水稻种子 RNA提取 完整性 提取方式 耗材处理
• 年，卷（期）: 2020,（29）
• 所属期刊栏目: 生物科学
• 页码范围: 37-46
• 页数: 10页
• 分类号: Q946.2
• 语种: 中文

摘要

水稻种子总RNA提取在水稻分子遗传基础实验中起着非常重要的作用,然而,高质量水稻种子RNA的获取难度高,极大阻碍了cDNA文库构建、RNA-Seq和基因表达分析等相关研究工作的开展和深入.为了探讨水稻种子总RNA提取的相关影响因素,寻找合适的水稻种子总RNA提取方式,本研究通过比较Trizol法、GeneMark试剂盒法和艾德莱试剂盒法3种不同的提取方式、不同的耗材处理方法、研磨方式等不同因素改进水稻种子总RNA的提取效果.不同的检测结果显示,艾德莱多糖多酚提取试剂盒能够提取到28S、18S条带完整、降解少和纯度高的水稻种子总RNA;不同耗材处理方法中,蛋白酶K处理过的耗材提取的总RNA比另外两种方法处理过的耗材提取的总RNA降解更少,28S和18S条带更清晰和完整、总RNA质量最高、效果最好;而研磨方式上,液氮冷冻研磨法能够有效抑制RNA酶对RNA的降解.本研究对水稻种子RNA提取过程相关因素的分析和改进,为促进以水稻种子为研究对象的分子实验奠定了一定的技术基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈志强		51	592	14.0	22.0
2	肖武名		6	41	3.0	6.0
3	谢月兰		1	0	0.0	0.0
4	崔欢		1	0	0.0	0.0
5	王长龙		1	0	0.0	0.0