喜马拉雅紫茉莉MYB家族的生物信息学及表达分析

• 作者: 佘露露 兰小中 刘佳佳 刘欢 卢存福 杨佳慧 陆雅宁 陈玉珍
• 来源期刊: 中国农学通报
• 学科: 农学
• 关键词: 喜马拉雅紫茉莉 转录组 MYB基因家族 生物信息学分析 类黄酮
• 年，卷（期）: 2020,（29）
• 所属期刊栏目: 生物科学
• 页码范围: 54-61
• 页数: 8页
• 分类号: S58
• 语种: 中文

摘要

旨在筛选高山植物喜马拉雅紫茉莉调控类黄酮等次生代谢产物合成的MYB转录因子(MhMYB)基因家族.基于喜马拉雅紫茉莉愈伤组织低温转录组测序数据库,利用PlantTFDB 3.0和BLASTP等软件对MhMYB序列进行筛选与鉴定,使用Web Logo 3.0、MEGA 7.0和Mev等生物信息学软件对MhMYB转录因子进行结构域、系统进化及低温诱导表达水平分析.研究筛选出34个喜马拉雅紫茉莉MhMYB家族成员,分别为1R-MYB(2个)、R2R3-MYB(30个)和3R-MYB(2个)3类转录因子;亚细胞定位预测大多数定位于细胞核中;进化分析显示,MhMYB家族成员可分为15个亚类,基于拟南芥AtMYB家族成员的生物学功能,预测MhMYB的S2、S7、S20亚家族成员可能参与调控类黄酮等次生代谢产物合成;转录组数据分析显示,低温可诱导MhMYB6、MhMYB15、MhMYB62基因表达水平增加;共表达分析发现,MhMYB6、MhMYB15、MhMYB62对类黄酮合成途径基因起到一定调控作用.初步研究表明,MhMYB6、MhMYB15、MhMYB62可参与调控低温诱导喜马拉雅紫茉莉类黄酮的累积.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	兰小中		60	402	10.0	17.0
2	刘佳佳		1	0	0.0	0.0
3	佘露露		1	0	0.0	0.0
4	陆雅宁		1	0	0.0	0.0
5	杨佳慧		1	0	0.0	0.0
6	刘欢		1	0	0.0	0.0
7	卢存福		1	0	0.0	0.0
8	陈玉珍		1	0	0.0	0.0