风干肉中产脂肪酶瑞士乳杆菌TR13全基因组测序及序列分析

• 作者: 张开屏 曹凯慧 李权威 田建军 赵艳红 靳烨 马俊杰 马牧然
• 来源期刊: 食品科学
• 学科: 工学
• 关键词: 瑞士乳杆菌 全基因组测序 基因功能注释
• 年，卷（期）: 2020,（16）
• 所属期刊栏目: 生物工程
• 页码范围: 101-109
• 页数: 9页
• 分类号: TS201.3
• 字数: 7439字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7506/spkx1002-6630-20190707-086

摘要

瑞士乳杆菌TR13是从自然风干羊肉中分离筛选到的1 株产脂肪酶活性高的菌株,为能够更好地研究该菌株在羊肉发酵过程中的代谢机理和功能,采用PacBio Illumina HiSeq测序平台对细菌TR13进行完成图测序分析.结果表明,瑞士乳杆菌TR13基因组为1 套环状无质粒分子,基因组序列总长度为2 172 224 bp,GC含量为36.82％.基因组中预测到2 536 个编码基因,编码基因总长度为1 883 532 bp,平均长度为799.46 bp,平均密度为1.08 个/kb,对应蛋白质平均序列长度为265 aa,占基因组百分比为86.71％.TR13菌株基因组中包含15 个rRNA操纵子和63 个tRNA.预测到可能的毒力基因75 个,耐药基因150 个.编码基因通过GO、COG和KEGG数据库的对比分析,完成了TR13菌株基因组基本功能注释和代谢通路基因信息注释,注释信息可为菌株应用研究提供一定理论依据.