利用转录组分析款冬萜类化合物生物合成关键酶基因及表达特征

• 作者: 刘计权 杜晨晖 王晓英 王莉花 贺润丽 韩毅丽
• 来源期刊: 中草药
• 学科: 医学
• 关键词: 款冬 转录组 萜类化合物 生物合成 基因表达
• 年，卷（期）: 2020,（20）
• 所属期刊栏目: 药材与资源
• 页码范围: 5302-5310
• 页数: 9页
• 分类号: R282.12
• 语种: 中文
• DOI: 10.7501/j.issn.0253-2670.2020.20.024

摘要

目的 挖掘与款冬萜类化合物生物合成途径相关的关键酶基因.方法 利用Illumina HiSeq2500测序平台对野生款冬花蕾和叶进行转录组测序,使用Trinity软件de novo从头组装,并通过基因功能注释、差异表达基因分析等生物信息学方法进行分析,挖掘款冬中萜类化合物生物合成途径相关的酶基因.结果 转录组测序获得39912371条高质量reads (SRA号:SRR9113366,SRR9113367),组装获得91118条Unigene,55830条Unigene在NR、Swiss-Prot、GO、COG、KEGG等数据库得到注释.鉴定出参与款冬萜类化合物生物合成相关酶基因的129个Unigene,包括91个参与三萜骨架生物合成酶基因,32个萜类合成酶基因,6个细胞色素P450基因,其中差异表达基因25个,涉及上游MVA途径的4个差异基因在花蕾中表达量高于叶,MEP途径的5个差异基因在叶中表达高于花蕾,另外还有10个基因在叶中高表达,9个基因在花蕾中高表达.根据差异基因HMGR、TPS、AS、CYP450基因在花蕾中高表达,推测可能与花蕾中萜类物质含量高有关.结论 从款冬转录组数据库中初步获得了可能参与萜类化合物生物合成途径的候选关键酶基因,为进一步阐明款冬萜类化合物生物合成的分子机制奠定基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	贺润丽		2	0	0.0	0.0
2	王晓英		1	0	0.0	0.0
3	韩毅丽		1	0	0.0	0.0
4	刘计权		1	0	0.0	0.0
5	杜晨晖		1	0	0.0	0.0
6	王莉花		8	74	4.0	8.0