肺腺癌预后关键基因的筛选、验证及其调控通路分析

• 作者: 仵红娇 张雪梅 李佳莹 李昂 谢俞宁
• 来源期刊: 山东医药
• 学科: 医学
• 关键词: 肺腺癌 TCGA数据库 GEO数据库 预后 差异表达基因 生存分析
• 年，卷（期）: 2020,（23）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 1-5
• 页数: 5页
• 分类号: R734.2
• 字数: 3478字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1002-266X.2020.23.001

摘要

目的 筛选肺腺癌预后关键基因并进行验证,分析其调控通路.方法 从TCGA和GEO数据库获取肺腺癌转录组数据,筛选共同差异表达基因.将LASSO引入到COX回归模型中,进一步筛选预后关键基因.计算TC-GA数据库获得的500例肺腺癌患者的预后关键基因相关风险评分,以风险评分中位数作为临界值将患者分为高风险组和低风险组,比较两组5年生存率.采用GEPIA数据库分析癌组织预后关键基因表达,Kaplan Meier-plotter数据库分析预后关键基因表达与肺腺癌患者预后的关系.采用基因集变异分析(GSVA)预测肺腺癌预后关键基因的调控通路.结果 在TCGA、GEO数据库共得到166个共同差异表达基因,回归分析筛选出DCN、RRAS、ECT2和PCP4是肺腺癌预后关键基因.高、低风险组5年生存率分别为29.3％、48.4％,两组比较P<0.01.肺腺癌组织中DCN、RRAS mRNA表达均低于正常肺组织,PCP4、ECT2 mRNA表达均高于正常肺组织(P均<0.05).RRAS、PCP4、ECT2高表达者5年生存率明显低于低表达者,DCN高表达者5年生存率明显高于低表达患者(P均<0.01).GSVA结果显示,DCN、RRAS、ECT2和PCP4可能通过调节细胞周期、DNA损伤修复等途径影响肺腺癌患者的预后.结论 DCN、RRAS、ECT2和PCP4是肺腺癌患者预后相关的关键基因,癌组织RRAS、PCP4、ECT2表达升高及DCN表达降低

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张雪梅		20	32	4.0	5.0
2	仵红娇		7	7	1.0	2.0
3	谢俞宁		7	8	1.0	2.0
4	李昂		6	4	1.0	2.0
5	李佳莹		2	1	1.0	1.0