龙眼Myb-related-R1的克隆及生物信息学分析

• 作者: 徐炯志 李浩然 李琳 潘介春 王金英 王颖 谭春露 邓英毅 黄幸
• 来源期刊: 安徽农学通报
• 学科: 农学
• 关键词: 龙眼 基因克隆 Myb-related-R1 端粒
• 年，卷（期）: 2020,（9）
• 所属期刊栏目: 分子生物·遗传育种
• 页码范围: 12-16,32
• 页数: 6页
• 分类号: S667.2
• 字数: 4975字
• 语种: 中文

摘要

目的:以龙眼成熟叶片为试验材料,研究Myb-related基因在龙眼中的表达情况,初步推出侧该基因的功能.方法:通过转录组测序及生物信息学分析得到龙眼Myb-related R1基因全长序列,进一步设计特异引物对其开放阅读框(ORF)全长序列进行克隆和生物信息学分析.结果:Myb-related-R1基因与SANT超家族基因片段有相似之处,ORF长度为879bp,编码292个氨基酸,有1个Myb结合位点.该蛋白属于非跨膜亲水蛋白,亚细胞定位预测定位于细胞核,存在35个氨基酸磷酸化位点.其二级结构主要由α-螺旋和无规则卷曲构成,二级结构与三级结构预测结果高度一致,同源基因进化树分析表明,该基因与阿月浑子蛋白组亲缘关系最近.结论:根据其他物种该基因的功能及生物信息学软件预测结果,可初步推测该基因功能与染色体端粒结构有关,且与花青素合成有关.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	徐炯志	广西大学农学院	46	221	9.0	12.0
2	王颖	广西大学农学院	21	82	4.0	8.0
3	潘介春	广西大学农学院	70	334	9.0	15.0
4	李琳	广西大学农学院	8	8	2.0	2.0
5	黄幸	广西大学农学院	8	14	2.0	3.0
6	邓英毅	广西大学农学院	31	81	5.0	7.0
7	王金英	广西大学农学院	5	6	2.0	2.0
8	李浩然	广西大学农学院	3	0	0.0	0.0
9	谭春露	广西大学农学院	2	0	0.0	0.0