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黄曲霉转录因子AfMcrA的克隆及功能预测
黄曲霉转录因子AfMcrA的克隆及功能预测
作者:
付亚娟
张慧敏
张文静
许笑晴
陈红豆
高梦迪
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
黄曲霉
转录因子
锌指蛋白
次级代谢
基因克隆
功能预测
摘要:
为初步探究黄曲霉McrA的生物学功能,采用反转录聚合酶链式反应(reverse transcription-polymerase chain reaction,RT-PCR)克隆黄曲霉转录因子AfMcrA基因,并对其编码蛋白的理化性质、保守结构域、亚细胞定位、二级结构等进行预测.实时荧光定量聚合酶链式反应(quantitative reverse transcription-polymerase chain reac-tion,qRT-PCR)对不同培养时间AfMcrA的表达情况进行分析.结果表明,AfMcrA基因全长1448 bp,由3个内含子和4个外显子组成.cDNA为1101 bp,编码366个氨基酸.生物信息学预测,AfMcrA是一个分子质量为39.82 kDa,理论等电点为8.97,不稳定的亲水蛋白,且不含信号肽和跨膜结构域;AfMcrA具有一个高度保守的Zn(Ⅱ)2 Cys6锌指结构域,属于C6转录转因子;PredictNLS预测AfMcrA亚细胞定位于细胞核中;AfMcrA二级结构主要由无规则卷曲组成,延伸链、α-螺旋和 β-转角含量较低.qRT-PCR结果显示,AfMcrA的相对表达量在培养6 d时达到峰值,分别为培养2 d和8 d的15.79倍和14.76倍.结合qRT-PCR结果及已报道McrA的功能,推测AfMcrA可能参与黄曲霉次级代谢产物合成的调控.
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信号转导
内容分析
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文献信息
篇名
黄曲霉转录因子AfMcrA的克隆及功能预测
来源期刊
食品与发酵工业
学科
关键词
黄曲霉
转录因子
锌指蛋白
次级代谢
基因克隆
功能预测
年,卷(期)
2020,(20)
所属期刊栏目
研究报告
研究方向
页码范围
46-52
页数
7页
分类号
字数
语种
中文
DOI
10.13995/j.cnki.11-1802/ts.024297
五维指标
作者信息
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姓名
单位
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付亚娟
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陈红豆
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锌指蛋白
次级代谢
基因克隆
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研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
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期刊影响力
食品与发酵工业
主办单位:
中国食品发酵工业研究院有限公司
全国食品与发酵工业信息中心
出版周期:
半月刊
ISSN:
0253-990X
CN:
11-1802/TS
开本:
大16开
出版地:
北京酒仙桥中路24号院6号楼
邮发代号:
2-331
创刊时间:
1970
语种:
chi
出版文献量(篇)
12595
总下载数(次)
34
总被引数(次)
107055
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