DEHP胁迫下萝卜的亚显微结构及应答转录组分析

• 作者: 冉咏兰 阚建全
• 来源期刊: 食品与发酵工业
• 关键词: 邻苯二甲酸二辛酯 萝卜 亚显微结构 转录组 差异表达基因
• 年，卷（期）: 2020,（21）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 98-106
• 页数: 9页
• 语种: 中文
• DOI: 10.13995/j.cnki.11-1802/ts.024548

摘要

为探究邻苯二甲酸二辛酯(diethylhexyl phthalate,DEHP)胁迫下蔬菜差异基因的表达调控,以萝卜为试验材料,以空白处理为对照,在不同DEHP浓度(10、30、50 mg/kg)处理下,利用透射电镜观察萝卜块根亚显微结构,运用转录组高通量测序技术(RNA sequencing,RNA-Seq)技术对萝卜块根样品进行应答转录组分析.结果 表明:DEHP胁迫会破坏萝卜块根细胞的结构,导致细胞壁加厚变形,部分断裂,线粒体嵴数减少,内部嵴断裂变模糊甚至解体,且污染浓度越大,破坏越严重.在应答转录组分析中,10、30和50 mg/kg 3个污染组分别获得52707 576、47 261 670和48 651 920条Clean Reads,与对照组相比,分别产生9885、9 385和11 880个差异表达基因.基因本体(Gene Ontology,GO)分析结果显示:差异表达基因主要富集在代谢过程、刺激响应和催化活性等生物学过程中.京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)分析结果表明:差异表达基因主要参与苯丙氨酸代谢、亚油酸代谢、α-亚麻酸代谢、苯丙氨酸、酪氨酸和色氨酸的生物合成、甘氨酸、丝氨酸和苏氨酸代谢、苯丙酸生物合成、类胡萝卜素生物合成、半胱氨酸与蛋氨酸代谢等过程,其中丙氨酸-乙醛酸转氨酶、精胺合成酶、脂氧合酶和乙酰辅酶A酰基转移酶等通过半胱氨酸与蛋氨酸代谢、亚油酸代谢和α-亚麻酸代谢参与了萝卜的应答胁迫反应.以上数据将有助于揭示萝卜块根在DEHP胁迫下的应答机制和分子基础,以及相关抗性基因的挖掘和分子辅助育种等方面的研究.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	阚建全		170	1970	23.0	33.0
2	冉咏兰		2	0	0.0	0.0