猪丹毒丝菌强毒株与弱毒疫苗株SpaA基因生物信息学分析

• 作者: 刘博婷 彭凌 温权 蔡巩林 袁晓晴 陈锦红
• 来源期刊: 江苏农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 猪丹毒丝菌 SpaA 蛋白 弱毒菌株 生物信息学分析 B 细胞抗原表位
• 年，卷（期）: 2020,（17）
• 所属期刊栏目: 生物技术
• 页码范围: 70-76
• 页数: 7页
• 分类号: S852.61
• 语种: 中文
• DOI: 10.15889/j.issn.1002-1302.2020.17.012

摘要

对猪丹毒丝菌SpaA蛋白进行生物信息学分析,并对比了猪丹毒丝菌弱毒菌株和野生强毒菌株间的差异.结果 显示,由于猪丹毒丝菌GC42的SpaA蛋白缺少一段含有80个氨基酸的序列,使得该菌株的蛋白质相对分子质量、氨基酸组成、二级和三级结构与强毒株的SpaA蛋白质相比均有所差异,导致这2株菌株引发机体产生的免疫原性和抗原性强弱有所不同,推测这2株菌株中,SG7菌株的免疫原性相对GC42较强;GC42菌株的抗原性相对SG7菌株的抗原性来说较弱,而猪丹毒丝菌GC42菌株的毒力相对猪丹毒丝菌SG7菌株较弱,因此呈现弱毒菌株特性;推测2株菌株的氨基酸序列均在193～206、217～231、290～309、313～327、328～376、386～457区段具有较高的形成B细胞表位的可能性.