红鳍东方鲀及杂交鲀的脑和肾脏转录组比较分析

• 作者: 保明秀 刘福君 张钰渤 王盛南 王秀利 荆笛
• 来源期刊: 安徽农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 红鳍东方鲍 转录组 高通量测序 功能注释
• 年，卷（期）: 2020,（8）
• 所属期刊栏目: 动物科学·生物技术
• 页码范围: 106-109,128
• 页数: 5页
• 分类号: S917.4
• 字数: 4067字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.0517-6611.2020.08.026

摘要

为探究杂交鲍(红鳍东方鲍×菊黄东方鲍)与红鳍东方鲀差异的分子调节机制,利用Illumina高通量测序技术对红鳍东方鲍及杂交鲍的脑、肾脏样本组织进行转录组测序,筛选差异表达基因.结果 表明:通过RNA-seq技术共筛选到2 207个DEGs(脑)和1 823个DEGs(肾脏).其中在脑组织样本中有1 068个DEGs表达上调,1 139个DEGs表达下调,肾脏组织样本中有851个DEGs表达上调,972个DEGs表达下调;通过GO功能分类与KEGG富集分析,将脑组织的差异基因区分为60个功能类别及137个代谢途径,包括G蛋白偶联受体信号通路、跨膜转运、分子功能调节剂、钙离子结合等;肾脏组织的差异基因被区分为31个功能分类及142个代谢途径,包括氧化还原酶活性、肽酶活性、蛋白水解、细胞外区域等.该研究探讨了杂交鲀与红鳍东方鲀生长发育差异过程的相关分子调控机制,可为后续相关研究提供初步理论参考与依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王秀利	大连海洋大学水产与生命学院基因工程实验室	31	126	7.0	9.0
2	王盛南	大连海洋大学水产与生命学院基因工程实验室	2	0	0.0	0.0
3	刘福君	大连海洋大学水产与生命学院基因工程实验室	2	0	0.0	0.0
4	保明秀	大连海洋大学水产与生命学院基因工程实验室	2	0	0.0	0.0
5	荆笛	大连海洋大学水产与生命学院基因工程实验室	2	0	0.0	0.0
6	张钰渤	大连海洋大学水产与生命学院基因工程实验室	1	0	0.0	0.0