黑水虻抗菌肽的克隆及其生物信息学分析

• 作者: 尤忠毓 胡珊珊 邬开鑫 陈开莉 陈红贤
• 来源期刊: 江苏农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 昆虫抗菌肽 黑水虻 基因克隆 生物信息学
• 年，卷（期）: 2020,（24）
• 所属期刊栏目: 生物技术
• 页码范围: 49-52
• 页数: 4页
• 分类号: S188
• 语种: 中文
• DOI: 10.15889/j.issn.1002-1302.2020.24.009

摘要

为了开发新型昆虫抗菌肽资源,以黑水虻幼虫为研究对象,采用RT-PCR技术从黑水虻幼虫总RNA中扩增到一个新型抗菌肽基因DLP-5,并利用在线生物软件和工具分析了抗菌肽DLP-5的生物信息学特征.结果表明,DLP-5由40个氨基酸残基组成,分子量为4226.83 u,等电点为7.87,具有两亲性特征,其中N端为疏水性,C端为亲水性,具有3个磷酸化位点,无糖基化位点、信号肽序列和跨膜区.DLP-5的三级结构包含1个N端的loop区、1个α螺旋和1对反向平行β折叠,构成了防御素类抗菌肽典型的"环-螺旋-折叠"结构,说明DLP-5是一个新型的防御素类抗菌肽,可通过与微生物膜相互作用发挥其抗菌活性.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	尤忠毓		8	8	2.0	2.0
2	胡珊珊		1	0	0.0	0.0
3	陈开莉		1	0	0.0	0.0
4	陈红贤		1	0	0.0	0.0
5	邬开鑫		1	0	0.0	0.0