条斑紫菜海藻酸盐裂解酶的生物信息学分析

• 作者: 吴承燕 苏羽航
• 来源期刊: 广东化工
• 学科: 工学
• 关键词: 海藻酸盐裂解酶 条斑紫菜 生物信息学 分子动力学
• 年，卷（期）: 2020,（13）
• 所属期刊栏目: 试验与研究
• 页码范围: 11-13
• 页数: 3页
• 分类号: TQ
• 字数: 2629字
• 语种: 中文

摘要

为了了解条斑紫菜海藻酸盐裂解酶PyAly(Porphyra yezoensis alginate lyase)的结构与功能,试验通过生物信息学方法分析其理化性质、信号肽、跨膜区、亚细胞定位、结构及进行多序列比对,并将建模得到的结构进行分子动力学模拟.结果 表明:PyAly为亲水性蛋白,N端1-25位为信号肽,下游区域位于胞内,二级结构中无规则卷曲和α-螺旋占比较高,三级结构具有明显β-jellyroll结构,属于PL-7蛋白家族,尚未发现与其同源性较高的真核生物来源蛋白,活性位点处的保守氨基酸残基对其功能的发挥具有重要作用.优化后的蛋白结构较为合理,可为PyAly酶解机理研究奠定基础.