豫西黑猪线粒体COXI基因的扩增和系统发生分析

• 作者: 卞军平 周武 和俊豪 庞有志 徐硕辉 杨又兵 王丽 王阳阳 邢沛
• 来源期刊: 现代农业科技
• 学科: 农学
• 关键词: 豫西黑猪 线粒体 COXI基因 NJ树 ML树
• 年，卷（期）: 2020,（7）
• 所属期刊栏目: 动物研究
• 页码范围: 211-212
• 页数: 2页
• 分类号: S828.8+9
• 字数: 3417字
• 语种: 中文

摘要

豫西黑猪作为一个极具发展潜力的地方品种,其种质资源面临着基因混杂的风险.通过对豫西黑猪的线粒体COXI基因进行PCR扩增、测序,并与其他22种不同猪种的COXI基因进行序列比对,采用最大似然法(ML法)和邻接法(NJ法)建立系统发育树,探究其与其他猪种之间的遗传变异及种系发育关系.结果表明,23个猪种该基因序列保守位点和变异位点分别占总位点的96.5％和3.5％,不同猪种间线粒体COXI基因的相似度均在96.5％以上.豫西黑猪线粒体COXI基因表现出明显A、T碱基偏好性.系统发育树和遗传距离结果显示,豫西黑猪种内遗传距离较近,并且与杜洛克猪的遗传距离较近,说明豫西黑猪与杜洛克猪之间存在基因混杂情况.