兼容型maizeSNP384标记筛选与玉米杂交种DNA指纹图谱构建

• 作者: 田红丽 杨扬 王璐 王蕊 易红梅 许理文 张云龙 葛建镕 王凤格 赵久然
• 来源期刊: 作物学报
• 关键词: 玉米 SNP 位点组合 品种分子鉴定 DNA指纹图谱 芯片
• 年，卷（期）: 2022,（7）
• 所属期刊栏目: 作物遗传育种·种质资源·分子遗传学
• 页码范围: 1006-1015
• 页数: 9页
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1006.2020.93048

摘要

为加强玉米品种管理和知识产权保护, 评估确定了一套兼容多技术平台, 适于玉米分子鉴定的SNP位点组合, 该组合包含384个位点; 构建了335个玉米杂交种SNP-DNA指纹, 并针对位点和样品从各个角度进行分析。384个位点全部分布在基因内区域, 显示了较好的多态性; MAF、PIC、DP平均值分别为0.39、0.36、0.60, 384个位点中88%的位点MAF值高于0.30, 98%的位点PIC值高于0.30, 98%的位点DP值高于0.50。对335个玉米杂交种进行遗传相似系数两两比较, GD (1 − Nei遗传距离)的变异范围为0.60~0.99, GD≥0.98、0.95、0.90者分别占比0.10%、0.38%、1.40%; GS (相同等位基因比)的变异范围为0.50~0.99, GS≥0.98、0.95、0.90者分别占比0.03%、0.11%、0.35%。从384个位点中抽取最优位点组合, 12个位点组合时品种识别率为0.99, 20个位点组合能够识别335个品种。综上所述, 本研究报道的384个核心SNP位点具有兼容多平台、高稳定性、高重复性、高品种区分能力, 利用核心位点构建了335个玉米杂交种SNP-DNA指纹, 为玉米品种分子鉴定、指纹数据构建以及分子育种提供了关键数据支撑。