生长异质大西洋鲑转录组学分析

• 作者: 章昭 聂苗苗 高强 刘丹 王振吉 祁得林
• 来源期刊: 青海大学学报（自然科学版）
• 关键词: 大西洋鲑 生长异质 转录组测序 差异表达基因 信号通路
• 年，卷（期）: 2021,（1）
• 所属期刊栏目: 生物科学
• 页码范围: 8-15,43
• 页数: 9页
• 分类号: Q953.1
• 语种: 中文
• DOI: 10.13901/j.cnki.qhwxxbzk.2021.01.002

摘要

为探明大西洋鲑在养殖群体中存在生长异质的原因,本研究对大西洋鲑进行转录组学分析,包括生长慢速组(平均体重0.51 kg)和生长快速组(平均体重4.20 kg)各3尾鱼.结果显示,共有332003个基因得到了注释,并筛选出948个差异表达基因,包括363个上调基因和585个下调基因.随后对差异表达基因进行GO功能富集和KEGG通路富集分析,结果表明,有543个差异表达基因被富集到61个GO条目,其中与单生物过程、细胞、结合分子功能等相关的基因较多.KEGG富集显示,共有229个差异表达基因被富集到114个代谢通路中,其中富集在钙信号通路、神经活性受体-配体交互作用信号通路、紧密连接信号通路的基因较多.通过转录组测序及功能富集分析发现,肌球蛋白、过氧化物酶体增殖物激活受体以及苏氨酸的高表达,钙/钙调蛋白依赖性蛋白激酶II、谷氨酸受体基因的低表达引起相关代谢通路调控水平的改变可能是导致大西洋鲑生长异质性的重要因素.本研究为进一步了解生长异质大西洋鲑的生物学特性、基因分子机制、代谢途径和遗传繁育提供参考依据.