结合QTL-seq和连锁分析发掘水稻中胚轴伸长相关QTL

• 作者: 刘畅 孟云 刘金栋 王雅美 Guoyou Ye
• 来源期刊: 作物学报
• 关键词: 中胚轴 混合分组分析法 Δ(SNP-index) 连锁分析 候选基因
• 年，卷（期）: 2021,（10）
• 所属期刊栏目: 研究简报
• 页码范围: 2036-2044
• 页数: 8页
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1006.2021.02082

摘要

中胚轴长度(mesocotyl length, ML)是影响旱直播水稻出苗和早期幼苗活力的重要性状。发掘中胚轴伸长相关位点, 解析其遗传机制, 选育长中胚轴品种是促进旱直播技术推广最为经济和有效的方式。本研究以长中胚轴品种‘Changai’和短中胚轴品种‘IR 145’为亲本构建的F2遗传分离群体为材料, 构建长池和短池并开展深度重测序(50×)。利用Δ(SNP-index)和G-value两种方法在3号染色体29.56~33.28 Mb处鉴定到1个中胚轴伸长相关位点qML3。在候选区域开发KASP标记, 对184个F2株系开展连锁分析, 将候选区间缩小到28.89~31.03 Mb。结合基因注释、连锁分析和基因表达分析结果, 推测LOC_Os03g52450、LOC_Os03g56060、LOC_Os03g58290、LOC_Os03g58300、LOC_Os03g58320、LOC_Os03g56050和LOC_Os03g57640为候选基因。这些基因分别与植物激素的调控和细胞分裂相关机制有关。本研究发掘了一个水稻中胚轴伸长相关位点, 对选育长中胚轴品种有一定帮助。