环介导等温扩增技术在下呼吸道感染常见病原体检测中的应用

• 作者: 顾锦 郭会 周围 吴玉敏 毛易捷 孙靖 马锦洪 王玉月 史伟峰
• 来源期刊: 临床检验杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 下呼吸道感染 环介导等温扩增 肺炎支原体 结核分枝杆菌 下一代测序
• 年，卷（期）: 2021,（1）
• 所属期刊栏目: 感染性疾病分子诊断技术
• 页码范围: 12-16
• 页数: 5页
• 分类号: R446.5
• 语种: 中文
• DOI: 10.13602/j.cnki.jcls.2021.01.03

摘要

目的 应用环介导等温扩增技术(LAMP)检测下呼吸道感染患者标本中的13种病原体,为临床快速诊断感染性疾病提供依据.方法 收集疑似下呼吸道感染患者痰标本103例、肺泡灌洗液45例,常规培养分离细菌、真菌,用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)进行细菌鉴定,同时采用LAMP技术检测13种常见病原体(肺炎链球菌、金黄色葡萄球菌、耐甲氧西林金黄色葡萄球菌、大肠埃希菌、肺炎克雷伯菌、铜绿假单胞菌、鲍曼不动杆菌、嗜麦芽窄食单胞菌、流感嗜血杆菌、嗜肺军团菌、肺炎衣原体、肺炎支原体、结核分枝杆菌复合群),实时荧光定量PCR(RT-qPCR)检测45例肺泡灌洗液标本中肺炎支原体,LAMP法检出的结核分枝杆菌阳性标本用二代测序(NGS)技术验证.结果 148例标本中,质谱法检出率为42.6％(63/148),分离出病原菌81株;LAMP法检出率为68.2％(101/148),共检测出175种病原体.质谱法和LAMP法对金黄色葡萄球菌、大肠埃希菌、肺炎克雷伯菌、铜绿假单胞菌、鲍曼不动杆菌的检出率差异无统计学意义(P>0.05),但LAMP法对肺炎链球菌、耐甲氧西林金黄色葡萄球菌、流感嗜血杆菌和嗜麦芽窄食单胞菌的检出率高于质谱法(P<0.05).LAMP法从45例肺泡灌洗液中检出26例肺炎支原体,而采用RT-qPCR检出23例.148例样本中,LAMP法检出2例结核分枝杆菌复合群,并使用NGS验证为阳性.结论 与传统细菌培养鉴定相比,LAMP技术具有检测快速、准确、操作简便等优势,可为临床诊疗提供可靠依据.