猫科动物冠状病毒感染情况调查及其基因的进化分析

• 作者: 朱九超 李鑫 杨德全 杨显超 沈海潇 王建 葛菲菲 赵洪进 鞠厚斌
• 来源期刊: 野生动物学报
• 关键词: 新型冠状病毒 猫冠状病毒 血清型 生物型 序列分析
• 年，卷（期）: 2021,（1）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 21-28
• 页数: 8页
• 分类号: S852.65
• 语种: 中文

摘要

为了解冠状病毒在猫科动物的感染情况,对采自上海某动物园的猫科动物144份样品进行检测,并对获得的阳性样品进行扩增和测序.结果显示:SARS-CoV-2荧光RT-PCR检测全部为阴性;FCoV荧光RT-PCR检测阳性3份.测序结果显示,检测到FCoV的ORF3、ORF7和S基因均呈遗传多样性,序列存在很大的个体间差异.3a、3b和3c基因主要表现为氨基酸突变.7a基因在第9位(F)、12位(V)和47位(S)均未发生氨基酸替换.它们均具有完整的7 b基因.S基因的S1/S2裂解位点处有连续的R-R-S/A-R-R-S序列模体,符合FECV裂解位点的氨基酸序列特征.在第1045位(M)、1047位(S)和1108位(D)均没有发生氨基酸的完全替换.上述结果显示,这3株病毒均为致病性低的FECV.基于ORF3c和S2基因的遗传进化树显示,SH1951与SH2003和SH2004处于同一分支,与血清型Ⅰ型毒株的亲缘关系最近;而基于ORF7b基因的进化树显示,SH1951与SH2003和SH2004处于不同的遗传进化分支,表明它们之间的亲缘关系较远.因此,需要加强对野猫的管理与监测,防止野猫携带的FECV或其他病毒传染给豹猫.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	杨显超		6	4	1.0	2.0
2	赵洪进		5	0	0.0	0.0
3	王建		4	0	0.0	0.0
4	葛菲菲		2	0	0.0	0.0
5	李鑫		2	0	0.0	0.0
6	杨德全		3	5	1.0	2.0
7	沈海潇		2	0	0.0	0.0
8	鞠厚斌		3	0	0.0	0.0
9	朱九超		2	0	0.0	0.0