基于生物信息学探讨骨质疏松症与膝骨关节炎的关系

• 作者: 万雷 刘远祥 林燕平 汪悦东 王世浩 袁嘉尧 赵宇 陈桐莹 高丰禾 黄佳纯 黄宏兴
• 来源期刊: 中国骨质疏松杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 骨质疏松 膝骨关节炎 生物信息学 微小核糖核苷酸
• 年，卷（期）: 2021,（1）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 6-12
• 页数: 7页
• 分类号: R589.5|R684.3
• 语种: 中文

摘要

目的 利用生物信息学探索骨质疏松症与膝骨关节炎的关系.方法 通过GEO数据库查找骨质疏松症和膝骨关节炎血清基因芯片表达谱;采用GEO2R筛选出差异miRNA并在miRDB、Targetscan进行靶基因预测;DAVID6.8数据库对差异基因进行功能GO分析及KEGG信号通路分析;应用STRING、Cytoscape软件建立蛋白相互作用网络.结果 本研究共获得骨质疏松症与膝骨关节有交集的4个差异miRNA,蛋白相互作用网络共含278个节点与545条连线.筛选出10个核心基因:VEGFA、ESR1、CCND1、PRKACA、GSK3β、H2AFX、SHH、EGR1、DNMT3A、DNMT3B.结论 交集miRNA和核心基因的发现有助于了解骨质疏松症与膝骨关节炎的相关性,了解两病的相关发病机理,为药物的开发提供靶点.