Slit2在膀胱癌中的表达、信号通路及其与患者预后关系的生物信息分析

• 作者: 李扬 王云 李遵 朱朝阳
• 来源期刊: 河南大学学报（医学版）
• 学科: 医学
• 关键词: 膀胱癌 生物信息 Slit2基因 预后 信号通路
• 年，卷（期）: 2021,（1）
• 所属期刊栏目: 基础与临床
• 页码范围: 19-24
• 页数: 6页
• 分类号: R737.14
• 语种: 中文

摘要

〔目的〕 探讨Slit2在膀胱癌中的表达及其与患者预后关系.〔方法〕采用生物信息学方法,在GTEx数据库中检索Slit2基因在人体各种组织中的表达水平,在TCGA数据库中分析Slit2多种肿瘤组织及在膀胱癌中的表达.采用在线分析工具cBioPortal,分析Slit2基因突变情况.根据Slit2表达水平,分为高、低表达组,比较两组患者无疾病进展生存(DFS)和总生存(OS)是否存在差异.〔结果〕Slit2基因mRNA在膀胱癌患者癌组织中的表达水平明显高于癌旁正常膀胱组织(P<0.05),且Slit2表达水平与患者临床分期有关,分期越高表达水平越高(P<0.05).Slit2基因主要突变形式为融合突变、扩增突变、深度缺失突变和多重突变等.其中缺失突变占25.55％,同义突变占8.19％,无意义突变占2.01％.单核苷酸突变主要类型为C>T(28.51%)?G>T(13.64%)和C>A(9.85%).STRING 数据库中构建Slit2 相关基因蛋白网络,网络中共有21 个相关基因,基因间的联系为92,平均节点相关度为8.76,区域聚类指数为0.776,相关蛋白网络富集明显(P<0.001).蛋白网络相关基因KEGG 信号通路主要富集于Ras 信号通路?T 细胞受体信号通路?Rap1 信号通路和ErbB 信号通路等.Slit2 高低表达膀胱癌患者无疾病进展生存(DFS)和总生存(OS)间均存在明显的差异(P<0.05).无疾病进展生存(DFS)(HR=1.5, P =0.026)和总生存(OS)(HR=1.50, P =0.015),在Slit2 高表达组患者显著低于低表达组,提示Slit2 高表达是膀胱癌预后不良的因素.〔结论〕Slit2 基因在膀胱癌患者癌组织中表达水平明显上调,高表达与膀胱癌患者的预后不良有关.