基于数据库挖掘:TRIM44蛋白在结直肠癌中的表达差异分析

• 作者: 王鹏宇 胡圣晨 陈浙南 王彦 姜莹
• 来源期刊: 中南医学科学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: TRIM44 结直肠癌 信号通路 数据挖掘 巨噬细胞
• 年，卷（期）: 2021,（1）
• 所属期刊栏目: 肿瘤专栏
• 页码范围: 12-19
• 页数: 8页
• 分类号: R735.37
• 语种: 中文
• DOI: 10.15972/j.cnki.43-1509/r.2021.01.003

摘要

目的 通过数据挖掘分析TRIM44在结直肠癌中的表达及意义.方法 对TCGA和GEO数据库结直肠癌中TRIM44的数据进行R语言脚本分析,并通过GEPIA、TIMER等多个数据库进行了差异表达、生存分析、肿瘤纯度与免疫浸润的关系以及相关基因的共表达和GO与KEGG分析.结果 TRIM44在结肠癌中有明显的差异表达(P<0.001),TRIM44高表达者预后较差(P<0.05).TRIM44在直肠癌中无明显差异表达.GO和KEGG分析结果显示,TRIM44共表达基因富集于调节干细胞多能性信号传导途径等多个通路.进一步免疫浸润分析提示TRIM44与M0和M2免疫细胞基因有明显的相关性.结论 TRIM44可通过作用于M0和M2细胞影响CCL2基因表达,进而对结肠癌的发生和发展产生调控作用.TRIM44有望成为结肠癌早期诊断和免疫治疗新靶点.