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成都市猫诺如病毒的检测及VP1基因序列分析
成都市猫诺如病毒的检测及VP1基因序列分析
作者:
黄思琦
黄坚
杨晓农
郭琪
李妍
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
猫诺如病毒
病毒性腹泻
反转录-聚合酶链反应
VP1基因
摘要:
为了解四川成都市猫诺如病毒(FNoV)的感染情况,应用公开报道的3对PCR引物对127份临床采集的猫粪便样本(含临床腹泻样本71例,临床健康样本56例)进行FNoV核酸检测,并根据病毒基因片段序列构建遗传进化树.结果显示,采用猫诺如病毒特异性引物FNoV-F9/R15的检出率为9.45%(12/127),高于采用杯状病毒广泛性引物p289d-p290d(2.36%,3/127)及诺如病毒特异性引物JV12Y/13I的检出率(0.79%,1/127).检测发现在临床阳性样本中存在猫泛白细胞减少症病毒(FPV)、猫肠道冠状病毒(FECoV)和猫星状病毒(FAstV)的混合感染.12株临床阳性样本病毒的RNA聚合酶基因序列分析显示,它们与GenBank上提交的猫诺如病毒及狮子诺如病毒处于同一分支,证实为猫诺如病毒.基于VP1基因序列分析结果显示,临床毒株间核苷酸同源性为89.0%?100.0%,氨基酸同源性为96.5%?100%,均位于诺如病毒G1V.2分支.临床毒株可分为2个分支,其中4株与日本毒株(GenBank登录号:LC389583)、美国毒株(GenBank登录号:JF781268)关系紧密;而另外3株则独立聚为1个分支,并存在共有的氨基酸变异位点.结果表明,成都市猫群中存在FNoV的流行,并与其他猫肠道病毒呈现混合感染.采用引物FNoV-F9/R15检测灵敏度高,适用于FNoV的临床检测.由于FNoV基因不断变异,存在临床发病风险,需要对其进行持续监测.
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文献信息
篇名
成都市猫诺如病毒的检测及VP1基因序列分析
来源期刊
动物医学进展
学科
农学
关键词
猫诺如病毒
病毒性腹泻
反转录-聚合酶链反应
VP1基因
年,卷(期)
2021,(1)
所属期刊栏目
研究论文
研究方向
页码范围
25-32
页数
8页
分类号
S852.659.1|S858.293
字数
语种
中文
DOI
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节点文献
猫诺如病毒
病毒性腹泻
反转录-聚合酶链反应
VP1基因
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
动物医学进展
主办单位:
西北农林科技大学
出版周期:
月刊
ISSN:
1007-5038
CN:
61-1306/S
开本:
大16开
出版地:
陕西杨陵西北农林科技大学动物医学院
邮发代号:
52-60
创刊时间:
1980
语种:
chi
出版文献量(篇)
7631
总下载数(次)
22
总被引数(次)
56446
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