玉米ZmCPB1基因的克隆、表达及生物信息学分析

• 作者: 刘江 赵兴华 韩斌 王铭 路贵和 王长彪 李新征
• 来源期刊: 玉米科学
• 关键词: 玉米 ZmCPB1基因 子粒发育 克隆 生物信息学
• 年，卷（期）: 2021,（2）
• 所属期刊栏目: 遗传育种·品种资源|Genetics & Breeding·Germplasm & Resources
• 页码范围: 43-49
• 页数: 7页
• 分类号: S513.035.3
• 语种: 中文
• DOI: 10.13597/j.cnki.maize.science.20210207

摘要

从玉米中克隆ZmCPB1基因的cDNA序列,全长1 446 bp,编码481个氨基酸,蛋白质理论分子量为54.05 KD,等电点为8.59.生物信息学分析表明,ZmCPB1蛋白N端有跨膜结构,是跨膜蛋白.蛋白质二级结构含有48.44％的α-螺旋、4.99％的β-转角、10.60％的延伸链以及35.97％的无规则卷曲,该蛋白定位于内质网中.序列比对结果显示,ZmCPB1蛋白含有与子粒发育相关的保守区VKFVHRKALK.系统进化树分析表明,该蛋白与高粱、谷子、水稻和大麦的同源蛋白亲缘关系最近,同属一个亚支.实时荧光定量PCR分析ZmCPB1基因的表达模式,结果表明,ZmCPB1基因在3叶期的根、茎、叶以及雄穗和苞叶中表达量较低,在雌穗中的表达量较高.在玉米子粒发育的不同时期,ZmCPB1基因的表达量呈现一定的规律变化,在授粉后0～10 d,表达量逐渐达到最高峰,之后开始下降,在授粉15 d后降到较低水平.初步判断ZmCPB1基因与玉米子粒早中期发育有关.