蕨类植物rpoC1内含子缺失及其分子进化速率

• 作者: 彭阳 苏应娟 王艇
• 来源期刊: 作物学报
• 关键词: rpoC1 内含子 正选择位点 选择压力
• 年，卷（期）: null,（null）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 287-298
• 页数: 11页
• 语种: 中文
• DOI: 10.11983/CBB19105

摘要

rpoC1基因编码RNA聚合酶β亚基蛋白，在转录过程中与DNA模板结合，与β亚基形成的β-β亚基复合体构成RNA合成的催化中心。以rpoC1基因为研究对象，在贝叶斯因子大于20的条件下，用HyPhy软件位点模型检测到3个正选择位点和541个负选择位点；用PAML软件位点模型检测到10个正选择位点，其中3个位点的后验概率超过99%。此外，基于最大似然法构建64种蕨类植物的系统发育树，结合HyPhy软件分析rpoC1基因的转换率、颠换率、转换率/颠换率、同义替换率、非同义替换率以及同义替换率/非同义替换率，探讨rpoC1基因内含子丢失与分子进化速率的关系。结果表明，rpoC1基因内含子缺失对转换率、颠换率以及非同义替换率有一定影响。