贵州汉族人群21个非CODIS STR基因座的遗传多态性分析

• 作者: 张红玲 蔡鹏 熊玲 罗文钰 杨美庆 徐荣兰 王启燕 任峥 季晶焱 黄江
• 来源期刊: 贵州医科大学学报
• 学科: 医学
• 关键词: 法医遗传学 非DNA检索系统 贵州汉族 遗传多态性 短串联重复序列 亲权鉴定 个体识别
• 年，卷（期）: 2021,（2）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 159-164
• 页数: 6页
• 分类号: R89|DF795.1
• 语种: 中文
• DOI: 10.19367/j.cnki.2096-8388.2021.02.006

摘要

目的 调查贵州汉族人群21个非DNA检索系统(CODIS)的短串联重复序列(STR)基因座的遗传多态性,并评估其在法医学上的应用价值.方法 选取301例贵州汉族无关个体血样,采用AGCU21+1荧光标记复合扩增系统对样本进行聚合酶链式反应(PCR),3500型全自动遗传分析仪对PCR扩增产物进行电泳分离,GeneMapper ID-X 1.3软件进行STR基因分型,Modified-Powerstates软件包获得各基因座的等位基因频率、杂合度(H)、匹配概率(PM)、个体识别率(DP)、非父排除率(PE)、多态信息含量(PIC)、累积个体识别能力(TDP)、累积非父排除率(CPE)及各基因座的Hardy-Weinberg平衡检验,采用Genepop软件对两两基因座进行连锁不平衡分析;同时选择已报道的7个地区汉族人群作为参考,对8个汉族人群基因频率进行主成分分析(PCA),应用MEGA 7.0软件通过Neighbor-Joining(N-J)法构建8个地区汉族人群的系统发育树.结果 21个STR基因座共检测出了157个等位基因,436种基因型,基因频率介于0.0017～0.5847,PM介于0.0526(D19S433)～0.2268(D1S1627),DP介于0.7732(D1S1627)～0.9474(D19S433),PE介于0.2729(D1S1627)～0.5867(D22S1045),PIC介于0.5332(D1S1627)～0.8030(D19S433);TDP为1-4.6455×10-20,CPE为0.999998822;与已报道的7个汉族群体比较,贵州和湖南汉族人群遗传关系最近,与宁夏汉族份遗传关系最远.结论 21个非CODIS STR在贵州汉族人群具有较好的多态性及个体识别能力,可作为法医学亲权鉴定和个人识别的有效补充.