直接测序法构建圈养大熊猫MHC遗传档案

• 作者: 朱英 李裕冬 何鸣 胡兰 吴虹林
• 来源期刊: 四川动物
• 学科: 生物学
• 关键词: 大熊猫 MHC基因 遗传管理 PCR测序法
• 年，卷（期）: 2021,（1）
• 所属期刊栏目: 基础信息
• 页码范围: 46-52
• 页数: 7页
• 分类号: Q38|Q959.838
• 语种: 中文
• DOI: 10.11984/j.issn.1000-7083.20200145

摘要

主要组织相容性复合体(MHC)基因的遗传参数是濒危动物圈养遗传管理的重要参考依据.本研究通过建立MHC基因分型的直接测序方法,对中国大熊猫保护研究中心圈养的91只大熊猫Ailuropoda melanoleuca进行了3个Ⅰ类MHC基因(Aime-C、Aime-I、Aime-L)和4个Ⅱ类MHC基因(Aime-DQA1、Aime-DQA2、Aime-DQB1、Aime-DRB3)的遗传变异分析,发现该圈养种群拥有22条Ⅰ类MHC基因和23条Ⅱ类MHC基因,包括3条新发现的Ⅰ类MHC基因,分别命名为Aime-I*08、Aime-L*08和Aime-L*09.Aime-L*08与已报道的Aime-L*02、Aime-L*09与已报道的Aime-L*04的相似率分别为99.8％(1个碱基差异)和99.6％(2个碱基差异).直接测序法可直接对长片段的Ⅰ类MHC基因区域进行分型,且仅需掌握PCR扩增技术,不需要掌握聚丙烯酰胺凝胶电泳技术以及银染的显色技术,便于各繁育基地开展大熊猫MHC遗传档案的建立工作.此方法对我国大熊猫圈养种群的遗传管理体系的进一步完善具有重要的应用价值.