椰子SPL基因家族的生物信息学及其表达分析

• 作者: 钟雅珠 马伯军 范海阔 陈析丰 弓淑芳 刘蕊 窦雅静 孙熹微 肖勇
• 来源期刊: 中国南方果树
• 关键词: 椰子 SPL基因家族 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2021,（1）
• 所属期刊栏目: 研究简报
• 页码范围: 38-45
• 页数: 8页
• 语种: 中文
• DOI: 10.13938/j.issn.1007-1431.20200469

摘要

Squamosa promoter binding protein like(SPL)基因是植物特有的转录因子,在植物生长发育过程中发挥重要的调节作用.本研究根据已释放的椰子转录组序列信息和水稻SPL基因家族的蛋白序列信息,从椰子转录组中鉴定出24个CnSPL基因,分别命名为CnSPL1～CnSPL24.Pfam分析表明,椰子24个CnSPL基因同样具有拟南芥和水稻中的SBP-box保守结构域.通过聚类分析将24个基因分成6个亚族(G1?G6).RPKM分析表明,G5亚族的CnSPLl、CnSPL2、CnSPL3 和CnSPL4基因在椰子不同组织中均处于高表达水平,而G3亚族中CnSPL5、CnSPL7、 CnSPL11和CnSPL13基因在椰子不同组织中则均处于低表达水平.另外,CnSPL家族基因在胚愈伤组织中均有较高表达,说明CnSPL家族很可能参与椰子胚胎愈伤的形成与分化.