玉米SNAC基因的遗传变异及耐旱性调控

• 作者: 李国君 马艺文 徐丹阳 吴永波 宋洁 王楠 郝转芳 赵娟
• 来源期刊: 作物学报
• 关键词: 玉米 SNAC基因 遗传变异 耐旱性
• 年，卷（期）: 2021,（8）
• 所属期刊栏目: 作物遗传育种·种质资源·分子遗传学
• 页码范围: 1128-1138
• 页数: 10页
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1006.2017.01128

摘要

以我国玉米育种中常用的16份自交系为材料，通过对SNAC (Stress-responsive NAM，ATAF1/2，CUC2)基因编码区及上游启动子区800bp核苷酸序列进行测序，检测SNAC基因在不同杂种优势类群材料中的遗传变异。在12个SNAC基因中，其中有4个基因在上游800 bp区检测到遗传变异，有4个基因变异位点超过30个，多态性较高。虽然大多数SNAC基因变异以SNP (Single nucleotide polymorphism)为主，但在ZmNAC031467基因中检测到较多的插入缺失变异(InDel)，达到基因总遗传变异的63.3%。通过PLACE软件对上游启动子有变异的4个基因进行3种耐逆结合元件的预测，结果显示4个基因均含有3种耐逆结合元件，但是基因突变对启动子结合元件的影响较小。再对检测到的遗传变异进行核苷酸多态性分析和中性检验，有7个SNAC基因核苷酸多态性较高，其中ZmNAC080308基因的多态性达到0.00962，推测这些基因在遗传漂移过程中受自然选择影响较大。利用t检验初步发现ZmNAC070395和ZmNAC080398基因的2个变异位点与耐旱相关性状关联，为进一步分析SNAC基因核苷酸变异与耐旱性状的关系提供一定的借鉴。