利用水稻MAGIC群体关联定位抽穗期和株高QTL

• 作者: 申聪聪 朱亚军 陈凯 陈慧珍 吴志超 孟丽君 徐建龙
• 来源期刊: 作物学报
• 关键词: 水稻 MAGIC群体 抽穗期 株高 关联分析 QTL
• 年，卷（期）: 2021,（11）
• 所属期刊栏目: 作物遗传育种·种质资源·分子遗传学
• 页码范围: 1611-1621
• 页数: 10页
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1006.2017.01611

摘要

利用多亲本高代互交系(multi-parent advanced generation inter-cross，MAGIC)群体(DC1、DC2和8way)及其复合群体DC12 (DC1+DC2)和RMPRIL (DC1+DC2+8way)进行关联分析定位水稻抽穗期和株高QTL。2015年和2016年分别在江西和深圳收集3个MAGIC群体抽穗期数据，2016年在两地收集株高数据，结合Rice 55K SNP芯片进行基因分型，利用关联分析方法检测到3个影响抽穗期的主效QTL (qHD3、qHD6和qHD8)，分别位于第3、第6和第8染色体，且分别与已知抽穗期基因DTH3、Hd3a和Ghd8在同一区域。检测到5个影响株高的QTL (qPH1.1、qPH1.2、qPH1.3、qPH4和qPH6)，其中qPH1.1和qPH1.2位于已知基因Psd1和sd1附近，其余3个QTL为影响株高的新位点，但仅在1个群体和单个环境下被检测到，QTL表达受遗传背景和环境影响大。不同MAGIC群体定位抽穗期和株高的效果不同，在8亲本MAGIC群体8way及复合群体DC12和RMPRIL分别检测到5、5和6个抽穗期和株高QTL，明显多于4亲本群体DC1的2个和DC2的4个，而且作图的精度更高，表现在定位到的QTL显著水平高和与已知基因距离更近，尤其是复合群体的联合分析(如DC12和RMPRIL)的作图优势更为明显。