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海南省2016-2018年A(H1N1)pdm09亚型流感病毒基因特性分析
海南省2016-2018年A(H1N1)pdm09亚型流感病毒基因特性分析
作者:
崔蕾
王如敏
潘家兴
李丹丹
马焱
王丹
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
流感病毒
基因变异
HA基因
NA基因
摘要:
2009年A(H1N1)pdm09亚型流感病毒在墨西哥暴发,之后在全世界流行.为了解海南省2016-2018年A(H1N1)pdm09亚型流感病毒流行态势,分析血凝素(HA)与神经氨酸酶(NA)基因遗传进化特征与变异情况,本研究从中国流感监测信息系统获取海南省2016-2018年流感病毒病原学监测数据,选取5家流感监测网络实验室分离鉴定的37株A(H1N1)pdm09亚型流感毒株进行HA与NA基因测序,利用MEGA 10.1.8构建HA与NA基因种系进化树,并分析其氨基酸变异情况.结果显示,2016-2018年共出现3次A(H1N1)pdm09亚型流感病毒活动高峰.2017年10月份以后的分离株(4/8)与2018年大部分分离株(21/22)独立于疫苗株A/Michigan/45/2015聚为一个小支,发生20余处HA与NA氨基酸位点变异.与疫苗株A/California/7/2009(2010-2016)相比,2016-2018年流感病毒分离株在HA基因抗原决定簇上发生7处氨基酸变异并有一个潜在糖基化位点,未发现HA基因受体结合位点变异与NA基因耐药性变异.本研究提示,2016-2018年,A(H1N1)pdm09亚型流感病毒逐步发生规律性进化,氨基酸变异频率有增加趋势,今后应持续加强流感病毒病原学监测,密切追踪A(H1N1)pdm09亚型流感病毒基因变异情况,为科学防控提供理论依据.
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篇名
海南省2016-2018年A(H1N1)pdm09亚型流感病毒基因特性分析
来源期刊
病毒学报
学科
医学
关键词
流感病毒
基因变异
HA基因
NA基因
年,卷(期)
2021,(1)
所属期刊栏目
流感病毒研究论著
研究方向
页码范围
64-73
页数
10页
分类号
R371.1
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中文
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研究来源
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主办单位:
中国微生物学会
出版周期:
双月刊
ISSN:
1000-8721
CN:
11-1865/R
开本:
大16开
出版地:
北京西城区迎新街100号
邮发代号:
82-227
创刊时间:
1985
语种:
chi
出版文献量(篇)
2313
总下载数(次)
18
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