塔里木兔线粒体基因组全序列分析与系统进化研究

• 作者: 侯森林 周用武 徐燕红 时玉 黄娅琳 黄捷
• 来源期刊: 野生动物学报
• 关键词: 塔里木兔 线粒体基因组 特征分析 遗传多样性
• 年，卷（期）: 2021,（1）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 71-80
• 页数: 10页
• 分类号: Q953
• 语种: 中文

摘要

塔里木兔是我国新疆地区特有物种,已被列为国家Ⅱ级重点保护动物.本研究基于所测定的塔里木兔线粒体全基因组序列(全长17011 bp),进行了全序列的结构分析,结果表明塔里木兔线粒体基因组包含13个蛋白质编码基因、22个tRNA基因、2个rRNA基因和1个控制区.除了nad6在L链上以外,其他的蛋白质编码基因都在H链上.基于线粒体基因序列,通过生物信息学预测发现除了trnM和trnS1以外,其余tRNA都有经典的三叶草二级结构.线粒体全基因组具有AT偏好性,其结构与目前兔属其他物种线粒体基因组结构类似.并基于塔里木兔和GeneBank已有的12种兔属物种线粒体全基因组序列,分别用ML法和NJ法构建系统进化树,对其系统发生进行了探讨,结果表明塔里木兔与蒙古兔的亲缘关系较近.