福建省马铃薯黑胫病病原菌的鉴定及其遗传多样性分析

• 作者: 李华伟 林志坚 罗文彬 许国春 许泳清 纪荣昌 邱思鑫 汤浩
• 来源期刊: 植物保护学报
• 关键词: 马铃薯 黑胫病 Rep-PCR 遗传多样性 聚类分析
• 年，卷（期）: 2021,（2）
• 所属期刊栏目: 研究论文|Research reports
• 页码范围: 305-313
• 页数: 9页
• 语种: 中文
• DOI: 10.13802/j.cnki.zwbhxb.2021.2020272

摘要

为明确福建省马铃薯黑胫病病原菌的种类、分布情况及群体遗传特性,通过16S rDNA序列分析法对分离自福建省各马铃薯产区的90株黑胫病病原菌进行鉴定,并利用细菌基因组重复序列PCR(repetitive sequence-PCR,Rep-PCR)方法分析福建省不同地区的马铃薯黑胫病病原菌群体的遗传变异情况.结果 表明,经16S rDNA序列分析鉴定,引起福建省马铃薯黑胫病的病原菌包括黑腐果胶杆菌Pectobacterium atrosepticum、胡萝卜果胶杆菌巴西亚种P.carotovorum subsp,brasil-iense、胡萝卜果胶杆菌胡萝卜亚种P.carotovorumsubsp.carotovorum、帕曼蒂氏果胶杆菌P.parmen-tieri、P.polaris和达旦提狄基氏菌Dickeya dadantii.对90株菌株的Rep-PCR检测得到47多态性条带条,多态性比率为100.00％.按采集地区将菌株划分为8个群体,其等位基因数平均为1.48,有效等位基数平均为1.30,Nei's基因多样性指数平均为0.17,Shannon信息指数平均为0.26,多态性位点数平均为22.75,多态性位点百分率平均为48.40％.供试90株菌株之间的相似系数为0.584～1.000,遗传距离为0.149～0.602,群体遗传距离和地理距离之间无显著相关性.聚类分析结果表明当相似系数为0.605时,可将90株菌株分为4个类群,其中93.33％的菌株分布在Ⅰ和Ⅱ类群中,当相似系数为0.646时,第Ⅰ类群可分为2个亚群,第Ⅱ类群可分为3个亚群.表明福建省马铃薯黑胫病病原菌群体存在丰富的遗传多样性,Rep-PCR技术可用于其遗传多样性分析.