基于线粒体控制区的江苏湖鲚群体遗传多样性和遗传结构分析

• 作者: 李大命 唐晟凯 刘燕山 谷先坤 殷稼雯 蒋琦辰 朱凛 李春宁 张彤晴 潘建林
• 来源期刊: 海洋渔业
• 关键词: 湖鲚 线粒体控制区 遗传多样性 遗传结构
• 年，卷（期）: 2021,（2）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 149-159
• 页数: 11页
• 分类号: Q349
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1004-2490.2021.02.003

摘要

为掌握江苏省重要湖泊湖鲚(Coilia nasus taihuensis)群体的遗传多样性和遗传结构,利用线粒体控制区(D-loop)全序列分析了6个湖泊(太湖、滆湖、高邮湖、白马湖、洪泽湖和骆马湖)湖鲚野生群体的遗传多样性水平和群体分化情况.结果表明,6个群体共214尾样本的D-loop序列中,共发现103个变异位点,92种单倍型.6个群体的单倍型多样性为0.726～0.951,核苷酸多样性为0.00552～0.01036,6个群体整体的单倍型和核苷酸多样性分别为0.857和0.00729,表明湖鲚群体的遗传多样性较高,且符合高单倍型多样性和低核苷酸多样性特点.分子方差分析(AMOVA)结果表明,群体间变异百分比为6.20％,群体内变异百分比为93.80％,说明遗传变异主要来自群体内部.群体总的遗传分化系数(Fst)为0.06199(P<0.01),两两群体间的Fst显示,滆湖群体与其他群体间存在极显著的遗传分化(P<0.001),而其他群体间无显著分化(P>0.05).单倍型分子系统进化树和网络进化图显示,6个群体的单倍型形成了2个谱系,但谱系组成与群体地理分布无相关性.中性检验分析结果显示,湖鲚群体进化过程中经历过种群扩张,扩张时间大约发生在0.089～0.160百万年前.研究结果表明,湖鲚群体具有较高的遗传多样性,滆湖群体与其他群体具有极显著的遗传分化,且拥有多个独享单倍型,应将滆湖群体单独作为一个管理单位,其他5个群体作为一个整体进行管理和利用.