水稻小穗簇生基因OsCL6的定位及候选基因分析

• 作者: 刘维 陆展华 卢东柏 王晓飞 王石光 薛皦 何秀英
• 来源期刊: 中国水稻科学
• 关键词: 航天诱变 小穗簇生 基因定位 转录组测序 候选基因
• 年，卷（期）: 2021,（3）
• 所属期刊栏目: 研究报告|Research Papers
• 页码范围: 238-248
• 页数: 11页
• 语种: 中文
• DOI: 10.16819/j.1001-7216.2021.0604

摘要

[目的]通过对水稻小穗簇生基因的定位与候选基因分析,为进一步克隆幼穗发育过程中缩短枝梗长度造成小穗簇生的功能基因奠定基础.[方法]以航天诱变育种技术处理常规优质稻品种粤农丝苗获得一个稳定遗传的小穗簇生突变体cl6为试验材料,与粤金银占构建F1、F2作图群体,对簇生基因进行定位,结合转录组测序对候选基因进行预测与评价.[结果]遗传分析结果表明,突变体cl6的簇生性状由非完全显性单基因控制,混合分组分析法将该基因定位于第6染色体上约416 kb的区间.进一步通过表达谱分析、转录组测序技术、基因序列差异性分析和qRT-PCR验证等筛选出OsFBK16为最佳候选基因,其5′-UTR区域发生9个碱基的插入突变,暗示该基因可能通过二级结构改变调控转录或翻译水平,参与水稻幼穗发育过程中枝梗的分化.[结论]本研究结果为解析水稻二次枝梗和小穗梗缩短机制奠定一定理论基础.